MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium botulinum Ba4 str. 657 chromosome

Total Repeats: 114313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012658	TAG	2	6	2	7	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012658	T	7	7	12	18	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012658	T	7	7	54	60	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012658	CAA	2	6	61	66	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012658	ATAA	2	8	80	87	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012658	TA	3	6	90	95	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012658	GTT	2	6	98	103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012658	GGA	2	6	151	156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012658	AATA	2	8	199	206	75 %	25 %	0 %	0 %	237793321
10	NC_012658	AAGT	2	8	228	235	50 %	25 %	25 %	0 %	237793321
11	NC_012658	AAT	2	6	278	283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793321
12	NC_012658	TTAC	2	8	368	375	25 %	50 %	0 %	25 %	237793321
13	NC_012658	A	6	6	380	385	100 %	0 %	0 %	0 %	237793321
14	NC_012658	ACT	2	6	407	412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237793321
15	NC_012658	GAA	2	6	413	418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793321
16	NC_012658	A	6	6	417	422	100 %	0 %	0 %	0 %	237793321
17	NC_012658	A	7	7	435	441	100 %	0 %	0 %	0 %	237793321
18	NC_012658	ATA	2	6	444	449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793321
19	NC_012658	ATG	2	6	474	479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793321
20	NC_012658	CTA	2	6	486	491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237793321
21	NC_012658	GCA	2	6	554	559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237793321
22	NC_012658	TAGCAG	2	12	564	575	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	237793321
23	NC_012658	TTTA	2	8	601	608	25 %	75 %	0 %	0 %	237793321
24	NC_012658	TA	3	6	607	612	50 %	50 %	0 %	0 %	237793321
25	NC_012658	TGG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237793321
26	NC_012658	ATGC	2	8	644	651	25 %	25 %	25 %	25 %	237793321
27	NC_012658	TA	3	6	662	667	50 %	50 %	0 %	0 %	237793321
28	NC_012658	AGT	2	6	691	696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793321
29	NC_012658	TCT	2	6	704	709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237793321
30	NC_012658	AATT	3	12	726	737	50 %	50 %	0 %	0 %	237793321
31	NC_012658	GAT	2	6	746	751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793321
32	NC_012658	AAAT	2	8	769	776	75 %	25 %	0 %	0 %	237793321
33	NC_012658	TGA	2	6	802	807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793321
34	NC_012658	AGAA	2	8	829	836	75 %	0 %	25 %	0 %	237793321
35	NC_012658	AACA	2	8	881	888	75 %	0 %	0 %	25 %	237793321
36	NC_012658	AAT	2	6	889	894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793321
37	NC_012658	TACC	2	8	924	931	25 %	25 %	0 %	50 %	237793321
38	NC_012658	AGA	2	6	934	939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793321
39	NC_012658	GAA	2	6	1018	1023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793321
40	NC_012658	A	6	6	1022	1027	100 %	0 %	0 %	0 %	237793321
41	NC_012658	TA	4	8	1068	1075	50 %	50 %	0 %	0 %	237793321
42	NC_012658	TAA	2	6	1119	1124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793321
43	NC_012658	TAG	2	6	1128	1133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793321
44	NC_012658	TAA	2	6	1150	1155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793321
45	NC_012658	AAAC	2	8	1208	1215	75 %	0 %	0 %	25 %	237793321
46	NC_012658	ATT	2	6	1235	1240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237793321
47	NC_012658	AAG	2	6	1242	1247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793321
48	NC_012658	TAT	2	6	1259	1264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237793321
49	NC_012658	AGA	2	6	1276	1281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793321
50	NC_012658	AGA	2	6	1295	1300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793321
51	NC_012658	GAA	2	6	1382	1387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793321
52	NC_012658	TAC	2	6	1405	1410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237793321
53	NC_012658	A	6	6	1428	1433	100 %	0 %	0 %	0 %	237793321
54	NC_012658	TAA	2	6	1438	1443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793321
55	NC_012658	A	7	7	1447	1453	100 %	0 %	0 %	0 %	237793321
56	NC_012658	TAAA	2	8	1485	1492	75 %	25 %	0 %	0 %	237793321
57	NC_012658	AAAAAT	2	12	1503	1514	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	237793321
58	NC_012658	TAA	2	6	1531	1536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012658	TTAT	2	8	1541	1548	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012658	TTG	2	6	1549	1554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012658	ATT	2	6	1627	1632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012658	CAA	2	6	1684	1689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012658	CTA	6	18	1693	1710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_012658	TAT	2	6	1714	1719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012658	TCTATT	2	12	1724	1735	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_012658	TAA	2	6	1753	1758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012658	AGG	2	6	1759	1764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012658	A	7	7	1789	1795	100 %	0 %	0 %	0 %	237793322
69	NC_012658	TAT	2	6	1858	1863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237793322
70	NC_012658	TTA	2	6	1873	1878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237793322
71	NC_012658	TAA	2	6	1883	1888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793322
72	NC_012658	ATA	2	6	2001	2006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793322
73	NC_012658	AAAT	2	8	2032	2039	75 %	25 %	0 %	0 %	237793322
74	NC_012658	AGA	2	6	2045	2050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793322
75	NC_012658	ATA	2	6	2064	2069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793322
76	NC_012658	AT	4	8	2094	2101	50 %	50 %	0 %	0 %	237793322
77	NC_012658	TAT	2	6	2129	2134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237793322
78	NC_012658	T	6	6	2149	2154	0 %	100 %	0 %	0 %	237793322
79	NC_012658	A	6	6	2174	2179	100 %	0 %	0 %	0 %	237793322
80	NC_012658	TAG	2	6	2275	2280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793322
81	NC_012658	AAG	2	6	2306	2311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793322
82	NC_012658	GTT	2	6	2316	2321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237793322
83	NC_012658	GATAAT	2	12	2322	2333	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	237793322
84	NC_012658	AGA	3	9	2387	2395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793322
85	NC_012658	TTTA	2	8	2435	2442	25 %	75 %	0 %	0 %	237793322
86	NC_012658	AAT	2	6	2459	2464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793322
87	NC_012658	ATT	2	6	2471	2476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237793322
88	NC_012658	TTA	2	6	2488	2493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237793322
89	NC_012658	GAA	2	6	2514	2519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793322
90	NC_012658	ATA	2	6	2532	2537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793322
91	NC_012658	AAG	2	6	2590	2595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793322
92	NC_012658	TAA	2	6	2641	2646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793322
93	NC_012658	AGA	2	6	2675	2680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793322
94	NC_012658	GTA	2	6	2688	2693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793322
95	NC_012658	GAT	2	6	2763	2768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793322
96	NC_012658	AGT	2	6	2790	2795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793322
97	NC_012658	TAT	2	6	2807	2812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237793322
98	NC_012658	A	6	6	2813	2818	100 %	0 %	0 %	0 %	237793322
99	NC_012658	AAT	2	6	2829	2834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793322
100	NC_012658	AAT	2	6	2868	2873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793322
101	NC_012658	GAT	2	6	2895	2900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793323
102	NC_012658	AATT	2	8	2910	2917	50 %	50 %	0 %	0 %	237793323
103	NC_012658	ATA	2	6	2923	2928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793323
104	NC_012658	T	6	6	2940	2945	0 %	100 %	0 %	0 %	237793323
105	NC_012658	CAA	2	6	2960	2965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237793323
106	NC_012658	T	6	6	2986	2991	0 %	100 %	0 %	0 %	237793323
107	NC_012658	AAGTTA	2	12	3005	3016	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	237793323
108	NC_012658	A	6	6	3029	3034	100 %	0 %	0 %	0 %	237793323
109	NC_012658	TAA	2	6	3075	3080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793323
110	NC_012658	ATT	2	6	3094	3099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237793323
111	NC_012658	TA	3	6	3108	3113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012658	AAT	2	6	3121	3126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012658	A	6	6	3134	3139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012658	TAT	2	6	3140	3145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012658	TAAT	2	8	3150	3157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012658	TA	3	6	3174	3179	50 %	50 %	0 %	0 %	237793324
117	NC_012658	A	6	6	3179	3184	100 %	0 %	0 %	0 %	237793324
118	NC_012658	TAA	2	6	3193	3198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793324
119	NC_012658	ATG	2	6	3211	3216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793324
120	NC_012658	CAAATA	2	12	3238	3249	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	237793324
121	NC_012658	TAA	2	6	3260	3265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793324
122	NC_012658	TA	3	6	3296	3301	50 %	50 %	0 %	0 %	237793324
123	NC_012658	ATAAAG	2	12	3334	3345	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	237793324
124	NC_012658	ATA	2	6	3367	3372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793324
125	NC_012658	AT	3	6	3427	3432	50 %	50 %	0 %	0 %	237793324
126	NC_012658	A	6	6	3444	3449	100 %	0 %	0 %	0 %	237793324
127	NC_012658	TAAA	2	8	3460	3467	75 %	25 %	0 %	0 %	237793324
128	NC_012658	ATAAAA	2	12	3468	3479	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	237793324
129	NC_012658	A	8	8	3476	3483	100 %	0 %	0 %	0 %	237793324
130	NC_012658	TGT	2	6	3509	3514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237793324
131	NC_012658	AGA	2	6	3527	3532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793324
132	NC_012658	AAT	2	6	3539	3544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793324
133	NC_012658	TAT	2	6	3609	3614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237793324
134	NC_012658	ATA	2	6	3631	3636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793324
135	NC_012658	GAAA	2	8	3648	3655	75 %	0 %	25 %	0 %	237793324
136	NC_012658	A	6	6	3665	3670	100 %	0 %	0 %	0 %	237793324
137	NC_012658	AAT	2	6	3675	3680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793324
138	NC_012658	ATG	2	6	3706	3711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793324
139	NC_012658	AG	3	6	3746	3751	50 %	0 %	50 %	0 %	237793324
140	NC_012658	TAAAT	2	10	3767	3776	60 %	40 %	0 %	0 %	237793324
141	NC_012658	ATT	2	6	3777	3782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237793324
142	NC_012658	AAG	2	6	3798	3803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793324
143	NC_012658	AGA	2	6	3818	3823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793324
144	NC_012658	ATT	2	6	3878	3883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237793324
145	NC_012658	T	6	6	3888	3893	0 %	100 %	0 %	0 %	237793324
146	NC_012658	A	7	7	3905	3911	100 %	0 %	0 %	0 %	237793324
147	NC_012658	GA	3	6	3918	3923	50 %	0 %	50 %	0 %	237793324
148	NC_012658	GAT	2	6	3951	3956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793324
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152	NC_012658	A	6	6	4058	4063	100 %	0 %	0 %	0 %	237793324
153	NC_012658	GAT	2	6	4095	4100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793324
154	NC_012658	TAA	2	6	4168	4173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793324
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157	NC_012658	TTC	2	6	4290	4295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237793325
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160	NC_012658	TTG	2	6	4413	4418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237793325
161	NC_012658	AT	3	6	4481	4486	50 %	50 %	0 %	0 %	237793325
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183	NC_012658	GATG	2	8	5314	5321	25 %	25 %	50 %	0 %	237793326
184	NC_012658	T	6	6	5369	5374	0 %	100 %	0 %	0 %	237793326
185	NC_012658	TAA	2	6	5382	5387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793326
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188	NC_012658	TAG	2	6	5627	5632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793326
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199	NC_012658	AT	3	6	6117	6122	50 %	50 %	0 %	0 %	237793326
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239	NC_012658	TTTAAA	2	12	7528	7539	50 %	50 %	0 %	0 %	237793327
240	NC_012658	TAA	2	6	7578	7583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793327
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251	NC_012658	TGA	2	6	7936	7941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793327
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254	NC_012658	TGG	2	6	8029	8034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237793327
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256	NC_012658	A	6	6	8073	8078	100 %	0 %	0 %	0 %	237793327
257	NC_012658	GAG	2	6	8079	8084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237793327
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261	NC_012658	TA	3	6	8190	8195	50 %	50 %	0 %	0 %	237793327
262	NC_012658	GAA	2	6	8226	8231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793327
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264	NC_012658	GAT	2	6	8315	8320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793327
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270	NC_012658	ATA	3	9	8474	8482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793327
271	NC_012658	CA	3	6	8485	8490	50 %	0 %	0 %	50 %	237793327
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